LncRNA Gene

ZFLNCG11346

Basic Information

Chromesome: chr20

Start: 54774163

End: 54778816

Transcript: ZFLNCT17590 ZFLNCT17591

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
ERR023145 heart normal 6.49
ERR023143 swim bladder normal 3.84
SRR630463 5 dpf normal 3.50
SRR1205160 5dpf transgenic sqET20 and GFP+ 3.38
SRR630464 5 dpf injected epidermidis 3.06
SRR1299124 caudal fin Zero day time after treatment 3.01
ERR023146 head kidney normal 2.89
SRR1049952 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein 2.69
SRR1048059 pineal gland light 2.64
SRR592698 pineal gland normal 2.55
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
etnk1 0.74
spsb3a 0.72
cbx8a 0.72
pfkpb 0.70
ppm1k 0.67
si:dkey-23c22.6 0.67
dnajb14 0.67
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LOC100005846 0.66
Gene Ontology Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT17590 NONHSAT176729; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG11346
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TTGACTGTACAATATTACATACAGTTGATTATATTATGATGCGGGCTAAAAATAACATTATGCACATCTA
AACTGAAAACAAACTTGTTTAAATGTCTTTCATATGTATATATTTAAACTATATTACATAACTGTAGTAT
TTAAAAAGCAGATTTACACTGTATTAATGTTAGCTACGCCTGTGTTTGACACACACTGAAGTATGAGTTA
TATGGTAATTCTTATTTTAGATTCGTGGCTTTCTATAATCAGACAGAGTTATTAATAGCACACACACACA
CTCGCCTCATAAACAGATGAAAGTCAGTGTTTCTGGCGTCTTCTTCCTCTCCTGACGTCTCTAACAGGTC
AGTGGTGTTATTAATCTGAGTGTTCCTCTATTCCTCATATCCTCAGCTTCAGCGCGCACACACACACACA
CACACACACACACACACACACACACACACAGATAAAGACACACTCATCCAAGACAAGACATCCTTCACAG
TTTATTTCAGTTCCTTTTCAATGCCATGTATATCTTTTATTCCTTTATTTATTAATTTTTATTTATTTAT
TTTCAAACCAGGAAGCACTTGGTCAGAAAAAAGAAAAGATTAAAACAGAACAATACGTCACCACATCCTT
GCAGCCAATAAACATTTTATTAACAACATGATCACAAATACTCCGATGTTTGTTCATTAGACTGAAATAA
CTGAAGAACTCCTGCGCATCACCTCAGATTAAAAAACTCCTATTAAATACATATTCCATGGCAAAAAAAA
AGGATTAAAAAAACTTTTTTAAAAAAGTAGTGAGAGAGGTATGAGAAATGTGCTCAGGGAAATCAAAAGG
CTAATTCTGACGTGATGTGCAAATATATTATTATTATCATCATTATTATTATTATTATTATTATTAATTC
CTACAGGTCTACCTACATCAACACACTGCTACTGCCACTACTACTAAAACAACAACTACTGTAATAATAA
TAATAATAATATGCATAATAATAACAATGACAAAATGAAAATACCTAAAATGACATGACGTTTTTTCTAT
TTTCTTCAGTTTCTGCAAAAGACTTTGAAAAGACTGCCACCGAAGATCAACTCGTACCAGAAAACAGTAA
GGTCAGTGCAAGTGTCCTTCATTCCACGTAACACATCTAAGGTTGCTGCAACGTTGCAGACATGTTAGAG
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GCTCTCAGAAAAGATGGAGGACCAGGGAATTATGGACATTATGTCGTGCTAATTCTACTGAGTTCATGTC
TAATGGCTGAAAAACAAGACAAAAAAAATCATTTGAGTCATCACTGCATATACATTTAGTCACGTCGTTT
AGAACCAGTAGCTGATTACAGTTCAAAAGTAATCTAAATGTAATCCAAAAGTAGTCAGATTACTTTAGCA
TAAGTGTCTAATCTAGCAATTCATATTACTGACTACAAATTTAATCATGTCATTTATATTAAGTTATTGA
CTGCTGTTAATCTAAATGTTAATCTAAATAAGTAATCTAAATGTAATCCAAAAGTAGTCCGATTACTTTA
TTGTAAAAGATAACAGATTATATACCTTTAGCTTCACACTCTTCAGATCTAACATTTCATGACATATCCA
GAGCTGGATAATAGCTATTAATACATGTAATCTGGATTATGTAATCAGATTACAAATATCAGAATATAAA
TTCGTGTAAACTACTTTTTCAAATACTCATAATCAAAAAGCAATCTACATGTAATCCAAAAGTACCCAGA
TTACATTACCATTAATGTGTAATCTACCAGATTATTTTACTGGTGACACATCTAATCATGTAATTTATAT
TAAGTATCTGATTGCAGTTAAAAAGTAATCTAAATATAATCTAAAGGTAGTCCGATTACTTTACCATTAA
TGTGTAATCTCACGAACCATATTAATGAAACCACACTATCTTCAGATCTAATATTCCACAGCATACCCAG
ATCTGGATATTAGCTATTAATATATGTAATCTGGATTATTTAATCAGATTACAAAATAAAAGTAATTAGA
GTAAACTACTTATATTAAATACCCATAATCAAAAGTAATCTAAATGTAGTCCAAAAGTAGTCAGATTACT
TAAGCGTAAAAGTTTAATCTAACAGATTTTATTACTGTAGCTACACACTCTTCAGATCTAACGTTTCATG
ACATATGCAGAGCTGGACAATAGCAGATTATACTGTATGTAATCTGGATTATGTAATCAGATTACAAAAA
TCAGGTAATTCGTGTAAACTACTTCTTAAATTCTCATAATCAAAAAGTAATCTACATGTAATCCAAAAGT
ACCCAGATTACATTACCATTAATGTGTAATTTAGCAGATTATATTACTGACGACACATCTAATCATGTAA
TTTATATTAAGTATCTGATTGCAGTTTAAAAGTAATCTAAATGTAATCCAAAAAGTAGTCAGATTACTTT
ACCATTAATGTGTAATCTAAGAATCATATTACTGAAGCTACACACTCTTCAGATCTAATGTTTCATGGCA
TATCCAGAGCTGGATAATCGCAGATTATATGTAATCTGGATTATGTAATTAGATTACAAACTACCCAATA
CCCATAATCAAAAAAGTTATCTACAGTAGGTGTAATTTAAACGTACTCAGATTATCATAAATGACTGATC
TAAAAGATTATCTCACTGACTACAATTTTAGTCATATAATTGATATCTGACTACAGTTCAAATGTAATCT
AAATGTAATCCAAAAGTAGTCAGATTACCATAAACACGTCATCTAGAACAGATTATATTACTGAAGCTAC
ACACTCTTCAGGTCTTATATTTCACGACATATCTAGAGCGGGATAATCGATTATTTAATCAGATTACAAA
ATTAAAGTAATTAGAATAAACTACTTACATTAAATACCCATAATCAAAAAATAATCTACAAGTAATCCAA
AATACTCAGATTACTTTACCATAAATGTGTAATATAGCAGATTATAGTTCAAAAGTAATCCAAAAGTAGT
CAGATTACTTTAGCGTAAAAGTGTAATCTAACAGATTATATTACTGAAGCTTTACACTCTTCAGATCTAA
CATTTCATGACATATCCAGAGCTGGATAATAGCTATTAATATTTGTAATCTGAATTATGTAACCAGATAC
CAAAAAATCAGGTAATTAGTGTAATCTTTTTAAATACTCATAATCAAAAAGTAATCTACATGTAATCCAA
CAGAATACTTTACCATTAATGTGTGATCTAACAGATGATATCACTGACTACACACTCTTCAGATCTAATA
TTTCATGGCATATCCAGAGCTGGATAACAGCAGATTAGATGTAATCTGGATTATTTAATTAGATTACAAT
ATTAAAGTAATTAGAATAATCTACTTTTTTAAATACCCATAATCACAAAAGTAATCTACGAGAAATCCAA
AAGATTACTTTACCATTATGTGTAATCTAACAGATTATATCACTGACTATAATTTTTAGTCATGTAGTTT
GAAAAGTAATCTGAGTTTAATCCAAAAGTACTCTGATTACGTTACCATGAATGTGTAATCTAACAGATTA
TATTACTGCCTACACATTTCATCATGTAATCTGTATTTGCACAGTATTCAGCATGATTTTCAGGAGTAAA
ACAACCCAACGCACCATCAATGATCTCGTCCTTCACCTTGTGTAGTTCCCGAACCACCTCCTCCAGGATC
TCCTGTTAATGACAGCATGTTTAAAGCAGCACAAACACACAGCAGACAGAGTGTGTGAACGGGAAGATCA
TCGTTACCTGTTTCATCCGGTCGAAGTCCAGCGCGTCTGAATCGCTGATGCTGCCCACCGGTCGAACCCT
GCAGACCCATTAAACACCTCATGAACTCTCTCCCCCCTCAGGGTTCAATAAGAAACTTAAATAGGAAGAT
AACTCTGATGTATATGAGGAAAGGAAACTTCTGTTAACATCATATCTGTCTACACTGGGATGGTTAAATT
AAGACAAGCCTCCTCCAAACAACAACAAAAATTACGCAAATTCCTAAATCTGTTATTTACAGTTGAAACT
ATCAATATAATATATTAAAAACAGAATTACAAAGGACAGAATAAACAGCGCACATTAGAGAAAAGCTGCA
AATACATTCAACATTTTATCATGCTCAAATGAACAGCCTAGTATACAGAAGCTGAATCAGACAAATTATT
ATTAAGAATTATTAGAATTAGAAGCGATCAAATCTAATTTTCTAGAAGGTATAGTTTAAATATACTTTAT
GATTAGTTATTTACACCCTTCATATTTAAGAGCAAGGAGCGCCCCCTGCTGGTCCGGCAGTACTATGCGT
ATAGGGAGGATCTGCTCTTTGATGATGTTTATTCCACCCTTTATATAAAGATCAACAATCTGGGAAATCT
GTATTTGTTTATTTATAGAACATATTTGAACATGTTTGTAATTCCAATCATTGTAAGACTATATACGAAA
ACAGCATTGTGAAATAAAGCACATGTAAAATCC