LncRNA Gene

ZFLNCG01904

Basic Information

Chromesome: chr3

Start: 36752436

End: 36762006

Transcript: ZFLNCT02782

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR527835 tail normal 30.76
SRR891511 brain normal 26.05
SRR527833 5 dpf normal 18.67
SRR726541 5 dpf infection with Mycobacterium marinum 17.93
SRR633544 larvae exposed to cold stress 17.47
SRR726542 5 dpf infection with control 16.55
SRR633550 larvae exposed to hypoxia stress 13.01
SRR065196 3 dpf normal 12.80
SRR1039573 gastrointestinal diet 0.75 NPM 12.57
SRR633516 larvae normal 11.96
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
lamtor1 0.51
Gene Ontology Download
GO P value
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KEGG Pathway Download
KO P value
ko04150 2.55e-02
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT02782 NONHSAT173562; Direct blastn
ZFLNCT02782 ENST00000592465; NONHSAT173562; NONHSAT172593; NONHSAT148168; NONHSAT148167; ENSMUST00000202427; NONMMUT097806; NONMMUT097805; Collinearity with conserved coding gene
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG01904
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AGGTAATATTGGTGGTGTTATTTTTTTTCGCTGTAACAGTTTTATAGGAACGAATAAAGTACTGACAAAA
AATGTATAACTTGTTATAAGAAATGCTTTCACTTATTTTTTTATTTGGTTAGGATGGACCAGGTTAAAGG
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TCTTTCACTCTCTCTCATTGAAAAGTGCCTTTCATATACCTTGTTTCAGCATCATCTGTTGTTGTAGCGG
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ATTTTCATTTTTTATTAGAATAAGCAGTCCCACACTTTATATTGAGTGGATTTAAATATGTTATTGCATG
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TAATAAACCAAATAATCTGTAGTGTATGGAAATGAGTGTGTATGAGTGTTTCCCAGTACTGGGTTGCGGT
TGAAAGGGCATCTGCTACGTAGTAAAAGTTGGCGGTTCATTCTGCTGTGGTGATCTCTGAAATGGAGACT
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GCATGTAATAAATTTGTAAATAATTTCTGTAATTACATTTATAATTACACAGTTGAGCATGCCTTACAAC
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TCATATTGCGCTATTTGCTTTTAACCTTTTAAAGTCCACAGGAACCGGAAGCTGGGACCATTTTTTGTAT
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TCTACTGCGATCTGATTGGATGTAGTAAAGTAGGAATTTCATTCAGGAAGATTGGGAAAAGTGTTTGGGG
AGAGTTATTTCAACCTAACACACTCCTCTTGATCACCATTTCTGTTTGTTGTCAAGGCTGACAGTTATAG
GGGCGTGGTTAAATGTGTTAGCCACACCCAATTCCTAAGATATATGTAATTGACAATTTAACTGAAAACA
AACAGGAAGTGAATTTCCAGATTTCAATTAGAGATTAGAAGGGCAACAAAAAATGTTCTTAATGACATGC
ACAGATTATTTGTTCGCAACAAAACTGGCAATGTGAGCTAACAAAATCAATATGGTTAGTTTTTAATTTC
ATGGGGACTTTAAACACTTCTTTTGCACAATATATTGTACAGTATTATGTAAAGTACTTGTATAATCTGC
CTTGGGCTGTGTGTACAGTCAACTGTTTAAAGTGCATGTAGAGTTGGATTACTGCTCCAGAATGTGAGTT
TTGTACAAGTTTAATTTCATGTCCACACATGTAAGCTGAAAGACAATAAAGCTCAACTTAAGGTGAACTT
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GCCAATGTTAAACTATTGTTTGATTGAATCTCTTTCTTCTTGTGACACATTGAGGTTACGGTACTGAATG
GCTTGTTTGTTATTATCGTGAACACTATATAAGCATTTGCTTCATCTGTAAAAGAGCAACCCTATACAAA
CGTATTATTTTAGCATCAAATGATCCTGGGTTTATCATTTCAGTGTACAGGCTTTCATAGACACTGTAGT
CTATGAGGTCTGGGAGACTCTTTTATTTAAAGGCTACATTTACACAATGATGAAGCCAAAAATATATTTT
CCCTTATGTTTTAACCTTTGATGTGCAAGCTTAGCAAACTTTTTAATGCACAAAATAGGTCATTTCAATA
AATACATTTTTAAAAGAAATGTGTTTTAAAAGGGTGGCACAGTGGCTCAGTGGTTAGCACTTTTGCTTCA
CAGCAGGAAGGTTGCTTGTTTAAGTCCCGGCTGGACCAGTTGGCATTTCTGTGTGCAGTTTGCATGTTCT
GCTTGTGTCCAGGCCCGGATTACGAATTCAGAGGCCCCTGGGCACAGTGTCTTGTAGGTCCCCTACCTGG
TCTCTATAGTTGAATTAAAAAAATAAGATTAATATAAAATTTTTAAAATAAAATGAATCTATAATGTATT
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AAAATGCTTACCCTAACTAGTGAAAATTTATGGATTTTATTATACTTTAAGTTAAAATAATCTATATTTA
AGGGTATTTTGAATGTAAAACTTCTATAAACGTATAATGGATATGATTTGGAGATAACATCTCTCCAGTT
CAGTTCTATGAATCTGAGTCCTCCATTAATAGACACACTTATTTATGATTCCTAATTGGCTTCCTCGTCA
GGAAGAGTAGGCTAAATCTGATATGTAGTGGAGAAAAGAAGATTGAGTTCATCAGACGTTGGATTCGAAC
TGGGTTCATGCTCGATCGGGCCAAAAGATGTTGCTATGCGCTTTATTGTGCTCTTTCCTTATGTTGTCTC
TGTCAATTAAACGGTGATGGGCATCCAACGATGTGCGCTATTTGCACTTAGCCCAAATAGACACTCCAAA
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CATTGGTTAATCCTGTCCTGCCCATGTCTGTATGGGTTTCCTTCGGGTGCTCCGGTTTCCCCCACAGTCC
AGAGACATACCGTATAGGTGAATTGGATTTAACTAAATTGGCCGTAGTGTGTGAATGAGTGTGTATGGAT
GTTTTCCAGTACTGGATTGTGGTTGGAAGGGCATCCACTGTGTAAAATATAAGCCGGAACAGTTGGTGGC
TCATTTCGCTTTGGCGACCTAAATAGAGAATAAGCTGAAGGAAAATGAGTGATTATGTTTTAAAAATGAT
TATTGTAGGTGCTCCTTATTCACGTATGTTTTTTTTTTTCCCCACAAATAATATAACTTTTTTACTTTAT
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CAAAAAGTATGAAAGGAAAAATGAAAATAAAATATTGACCATTGGAATACTGAATGATGAAAATAATTAT
TTGCAAAGATAGAACATAAGAGCTCAATTGGGTTAATACAGACCTATTTTGTGCATCAAAGGGTTAAAAA
TTCACGTTTACACGTTTTTCAAACTGATCAACAAAATTGCTAAAAACGCTGTAATTTGTATTCTAGGTCA
GTTTTTATTTTGTCACCTTTTTGGTAAATGGTACCTGTAGGAAATGAAGACTTGCAATTGGCGGCTTTGC
GCTGGTGTGTTTGTAGAATTTGCCGTGTGTGTAAGATGGGACTCCACTGCTGATTGCAATGTGAAGTAAA
TCAACACTTTGCTGACACTTGATCAAACACTTGAGCAACACCACCATCATCACATACTCCGCCATTGTTG
TGTGTTTGTTTGCGCTTTAATCAAGGCCTCATCATTTTCAGTAAAACACTTGTTTTTTCTGATGTTTACA
TGTCCACTTTAAAAGTATTGTTTCAAGCTGTTCACACACTGGCAACAAACAGTTGGCATCTGACATTTTC
TCCCAGAATGTGTTTTTCTCTGCCTCTTATGTTTATGTTCAGCTTTTTTACTTTAAAGATGGTCCAAAGA
ACCATAAACGTTAAATGACTACAACCTACACCTACCAACACGCATAAATATATCACAGTTTTTGCATCTG
AACTCTTTAAGTACATTCTTCGTTTTCCTCCTGTGAGCTTGTGTGGTTCTGTGCATAGTTGAGCACATTT
GAAGCTAACTACAGGTTATTCAGGAATAGTAACATTCTTTCCACTTAAACAAGTAAAGCATTTTCACTTT
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TTGACTCGAGCCCGTAACAGACTCACCACCCCGGCCAGCATGACTCTTCCTGAGCTTGCAGCAAGTGGCC
TCATGGTTTGTGCTTTTCTAGATTTTCACTTGACCCAAAAATGAACATTTTACTCTTCTTTTACTTGCCC
TCAAGTAGTTTCAGACCTTCATGTGATCTTTTTTTCTTTCAACACGGAAGTATTTTGATGTATGTTACAA
ACGAGTACCCTTTGTTTGCTATAGTAGGTAAATCATATACTTTAGAATTCAGTTGTTTTCAACATTCTTC
GGAATATCTTTGTTCAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGGTTTGAAACAAATGGAGGATGTGTAAATA
ATGGGAGAATTTTCATTTTGGGTGAACTTCACTGTAAAAAAAATGATGAAACAAAAGCTGTTATATTACA
TCAGCTTACACTACCTGACAAAAGTCTTGTCACCTATCCAAGTTTTAGGAACAACAAAGTATGACTTGAC
TTCTAGTTGATCGTTTGGTATCAGAAGTGGCTTATATGTAAGTCAAAGGCCTCTAGATTACACTTATTTT
ACCAAAATAAAGTATTATCATGCCTTGATTTTTAATTTTTCCTTTAGGACAGTAAGGTCTGACTTGGCTC
AGACAAAAGTCTTGTCGGTTAACAGAAATAATATCCAGTATAGAATATAAAGTCATGGCGCTGTGAAAAA
AGAATTAATATTGTGTAGTACTCCCATTAGCTTGGAGAGCTGCTACCATACATCTCTGCAATGAATCAAA
TAACTTATTAATAAAGTCATCTGGAATGGCAAAGAAAGCACTCTTGCCGGACTCCCAGAGTTCATCAGGA
TTCTTTGGATTCATCTTCACTGCCTCCTCTATCTTACCCTAGACATGCTCAATAACGTTTATGCCTGGTA
ACTGGGCTGGCCAATCCAGGAGCACCTTTTTTGCTTTCAGGAACTTTTGAAATGGAGGCTGTAGTATGAG
AGAGGCTGCTCTCCTGTGGTTTGTAATGTAATGGGCAGCACAAATGTCTTGATACCTCAGGCTGTTGATG
TTGCCATCCACTCTGCAGATCTCTCGCATGCCCCCATACTGAATGTAACCCCAAACCATGATCTTTCCTT
CACCAAACTTGACTGACTTCTTTAAAAATCTTGGGTTCATGCGAGTTCCAGTAGGTCTTCAGCAGTATTT
GTGATGACTGGGAGCAAGCTCAATAGATGATTCATCAGAAAAATCTGCCTTCTGCCACTTTTCCAAATGA
TCAACTAGAAGTCAAGTTATATGGTTGCTCTTACAACAGGGATCGACGACAAGACTTTTGTTGGGTAGTG
TAATTGTTTTACATTATACAAAGTTTAATATTTTTTGTAGTCAGTTTGACTGATGTATAAGTTGAAGACT
TGAAAAAATCAATTCAAGGCAGTACATTTTTTACAGTGTATCCCTTTAATATGGATGCTCAATCTGTTGT
TGTCTCTTTTTGAAACCTACAATATCTGTTCTGTTTGTTCTAGAAAATGTTTACACCTCCAATGCCGGGT
GACGTAATGGTGAACTTCTACATCAATCTCAGTAAACTGTGTTTGACGGTGTATCAACTACACGTGCTGC
AGCCTAACACTACTAAGGTATCAAGCTATCTTAAAAAGAAAACCTCTAGTTTGCTCGCCATAATTGTGTG
TTGAAATGCACTGTCATTTTGGTTTTCTGTTAGAACTTCAAACCGGCAGGAAGTTCAGTGCTGCATAATC
CAGGAGCAATGTTGTAAGTGCTCATTGCGTTTCCTGTTTTGATGCTTCAATGTCCTTCTTCTGCTTTTCC
TGTTTTGAAGCCGTCTGTTTGATGGAGCTTTCTTTTCTCCTCAAGTGAACACAACAACACCAAGTTCGAG
GTGAGCCACGTGCACAAGGTGGAGTGTGTGGTGCCGTGGCTGAACGACACGCTGGTGTTTTTCACCATTT
CTCTGCAGCTCTGCCAGCAGCTCAAAGATAAGGTGTGATGATTATAATCTCGCCTGCACAGTCACTGTCA
TTACTGATGATCAATGCATGCACAAAAACCAGAGGGTTATCAGAAGAACCAAGCAGTTTAGAATTACGTT
TGTAGGATTGTGTCAAAAATAATAAATATTTCCTTAATATTCCATTCACCAAACTTTTTTATATATTATT
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ACAACTATTAGCCTGAAAGCTATATATTTTATCGATAGTCTACAAAACACACCATCATTAAACATCATTA
AACTTGCCTAATTACACTAACCTGCCTTGTTCACCTTATTAACCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACGTTA
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AATCAGTTATTAGAAATGAGTTATTAAAACTTGTATGTTTAGAAATGTGTTGAAAAAAATCTTTGCTTTT
GTTAAACAGAAATTAGGGAAAAATTTACAGGGGAGCTAATGATTCTGGCTTTTTTTTTTAAATTATATTT
ATTCCTTTTTTTTTTTGTTTATTTATTATTTATGTATTTTTTAAGGATTAAAATATGTTAAGATCATCCA
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ATGGATTTTTACAGTGCACCATGGTTTAAATCTTCAAACTGCTGTTTCAGTGCAACTTTATGATACCAGC
TGAGAAATAAGGGTCTAACCTAGCAAAATGTTTGGTAATTTAAAAATAAATAATAAAAAATAATATTAGT
ACTACCTCAAACTTGGCATTGCTACCACAATACTTGCTAAAAGTTATAAGCTAAACGTTTTTAATTTTTT
ACTAAGGTCAATCTCAGTTGAACATTATCGCAATGTTAACCTTGTAATCGCAATAATTTTCTTCCTGTTC
ACAAGAAAAACATTTTAATGTGTCATGCAAAGTTTGTGATTTAACTGCTTTTAATTCTTCGGAGAATGAT
CAGTTTACAGACAGACAGCCTTTATGAGCAAAAGGATCCAAAGGATGTGCTCACGGGTGTTTTTAAAGAC
AATGTTACAATATCTTAGATAAGAGTTTCTCTACAGCTCCTTCACTCTTAAACAAACAGTAGATTACACA
TGGCTGTAATAGCCCAATGATTATTTGATTTTACTTTAGCAAAACCTTATTCAATTTATAATATCAACAT
ATAATTATCAATCATCAATATATGATCATAAAGATTAAAATTCATCACAACCTCTACAAGAACTAACATG
TTTATGTCTTTGCTCTTTCATTGCAGATTTCTGTCTTCTCTAGTTTCTGGAACTACAGACCATTTTAAGC
TACATCTGACCAAAACTCTACATTGAATGATCATTTAAAAAAGCTAAATA