LncRNA Gene

ZFLNCG05488

Basic Information

Chromesome: chr9

Start: 220380

End: 227630

Transcript: ZFLNCT08484 ZFLNCT08485

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR658535 bud Gata5 morphant 193.07
SRR658539 bud Gata5/6 morphant 165.24
SRR658533 bud normal 130.63
SRR658537 bud Gata6 morphant 120.70
SRR658543 6 somite Gata5 morphan 110.63
SRR527832 16-36 hpf normal 95.25
SRR658547 6 somite Gata5/6 morphant 62.56
SRR658541 6 somite normal 60.75
SRR658545 6 somite Gata6 morphant 60.58
SRR1049946 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO 46.70
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
rad23aa 0.67
napgl 0.65
samd4b 0.65
smg1 0.64
tmem160 0.63
cdc37 0.62
LOC101883183 0.62
lrp6 0.62
arid1aa 0.62
upf2 0.61
Gene Ontology Download
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KEGG Pathway Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT08485 NONHSAT082151; ENSMUST00000181328; Direct blastn
ZFLNCT08484 ENST00000547717; NONHSAT071396; ENSMUST00000192494; NONMMUT057775; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG05488
GACACATCTTGTTGTCTTTGTAAGAGTGGAGCTCGATCACGCCGCCGTGTCTTCCCTCTTCCCCGAATCC
TCTCAAAACTCCCTCCCGAACCTCCCCCTCTCTCCCTCCGGACCCTCGGACTCTCCCCCACCCGGAGCGC
ACGTCAGGTGAGCCTCCAGCGCGGTTCTGTCCTGCCCAAATGTGAGGCCCTGAAGGCCGCGGGCTGCGCT
AGCGATAGCGCTGATGCTAATCAGCCTGCGCGGTTTTCTAGCTCTCTCTGTCGACGCTCCGGTGCTCGGG
TCGCCCGTGTATACCGTGTAACCGGGCGCATGGCGGCGGCGGGTCGAGCTGGAGCGGGTTCGACGGCTGT
GGAGCGCGGTTGGCCGTCATGACGCGGTGTTACGCAGCTGGTAAACACGAGCTAACGCGGCTCCAGCGCG
CTGTTTATACCGCCTGCGGTCACTCCTAGCGGCCGATAACCTCACTTTTATACACTATTCCATATTTATT
CGACGTATATTAATAATAACGCGTGTTTATATCCTCTACTGGCGCTAAACATTGATCCAAGGCGTCAATA
ATGTCCGCCGTCAGTGTTTGTGTTGAGTCGTGTGCTTCAGACGCGTTTATTCAGCGTTTACTCGAGCTGT
GGCTTTACCAGGGTAATGCTCGAGCTGCTCAATCAGGGATCCTGTGGTTGTTACTGCGTGATTAATGATG
GACGTGATTTGACCTGTTCTGTTTTTATTATTGACGTTAGCAGTGGTATTACTGTTGTTTTTCAGTGGGA
GTGTTTTATAAATGCTCCTGTCGTAGTTGACTGTAGTGGAGGGCTTTAGGTGTGCTGTGTTGGTGTCGTG
TGTTTATTCATTCATACTCCATTACACAAGAAAAATGTTGTCTTCGTCGTGTGGGTTATCTCACTATAAC
TGGGGTTTATAATCAGCTTTATTATATTATAGTTCTTGCTCTGTTTGTGTGATTCATATTGTAATTTTGA
GTTTAGTATGCTTTTGTCGTAGCACCCTGGTCTTTGTGACGGTCAAATTATTATTGCTATTGATATTTAA
TTGGGTCGACTGCAGTATGTTTGATCTTGTCATTTTAATCTATGTAATGGGTGTGCCTTTTGTTTAATAT
TATTAATGTGTGGTGTGCTGATGTTCTGTGTTTGTGGGCTGCACAGGTTAATCATCCGTGACCAAAGATC
CAGATCTCTGCAGGCTGATCATCATGGACTCTGGAGTGATTGAAGGAGGGCTGAACGTCACGCTGACCAT
CCGGCTGCTCATGCATGGCAAAGAAGTGGGCAGCATTATTGGGAAGGTGTGTTGGAGAAGCTTCAGTTTG
TGTGCTCAGTCACATCATCACCACCACCACCATCATTATTATTGTCTACCGATACCAAAACCCGATCTGA
AACCTCTATAATACATTAAGAAAATAGAGTGAATAAACAGATCCAGGATGTTCCTTATTTTTTCATTTCA
CCTTACTTTATCATTCCACAACTCTCTTAACAAACACAGCGCTTCTGTGAGGGAGCTCAAACAATCAAGT
GATAAATAACAACATTTCTTCGCTTGGACTTAAGTGCAGGAGAAAATATATACAAACAAACAGCACCTGA
ACTTAAAATACCCTGCAGGCAATCCCAGGTTTACATATCTCACAGTTAGCTATGGCGATGTTGTCATCAT
CAGCTTTATAATACTTCCAGACCACAGACACACTTGCGCTTTCTTCTTCAATCTGCTTCTGTGCTCTACT
TTGCCGGCATTCAACTAATAGTGCCTCTGCAACAAAGTGGTTGCTACGTTGCTGTTTCTGGTTGAAGTCA
TGAAGGAGATGTTAAAATATTGAGTTTATATATATATATATATATATATATACGTATACACACATGCATG
CATAAATGTATATTCGAGTCCTGATCAGGATGTAATGTCCGATTCAGATTGGGTCTGAAACTGCATGATT
AGGCCCGCATTCCGCTCACGTGATTGGATCTGGACATCCCTAATTATTATTATGGTTAATATTATTACAG
CGATAATTCAGCATACAGTACAAATTGGCCTCGTTCTCTACCTTAAAGTTTACAAAAATTATCAGATGAT
TTACTCACCATCAGCTAGAACTGGACAATTAATTGAAAATAAACTAAAATTCACAACCTATAACCATCGT
CATTTTTATATGCCATTTTTACATGCCAGTTGTTTAGTCTAATTGTTCCTCTTCAAAAACATTACTGCAT
GTGGACAAACTAAGCGCTTCGGTTTTCCCTGACGGTGCGGTGAGTGTATATTAGGGCTGCACAATTAATC
GTATTGATATCATTATGGCAATATTTCTGACTACAGCGTCTCCAGCAGGACGTGACTCTGTCTAGATTGC
AACTTTGCTCTTGCTCAGTCCAAACGTCCCAACAAACCTCATTCCTCCCCTTAGAAACCATTACAACACC
GTGTCTCTCATCCTGATTTGTTGTTGAATGCTGAAGGTGGGAACTAATCAGAGGGCTAATGAGCTCAGAT
GGAGAATTCTGCATTGCGTTTTCATACGCATTACTAAACCAGAGAACATTTATTTTCAAAATGAGTCCTG
AAATATTGTTTATAGCGTTTCATTTCTTGCACAGAACGATCATTTGGCTTTATCAGGGCTCAGTGTATCA
TTAGGATTGATTGTACAGACTTGTTTGTAGGTTTCTATTGTTTATTTAATAAAGCTTTATCTAATAAAGA
CCACAGATTAATCTCAATTGTCTTTGATGAATAAAATAAAGCAAAAGACACACATTTTGTGTGACAGTAA
AAGTGTGATGTGATTAGCAAAAGCTCAGTTGTTGGTTGTTTGCAGCAAATCAGTCATTGAACCATAGTAA
AGTAGTAAACACATAGTAAACACAACACACCGCTAATGAACGCTATTTGGCTGAAGTGAAGGAGCGAAGT
GATGTTTTGATTAGACCCTTTAGATGTGCACCTTTATATGCTCATTTTTCTTTGGGGTTTTTAATATGCG
TGTAAAAGCAATTCTTGTGAAGATAATTTTATTTTTAAGATTGTCTTTTTACAACAAAACTGCATAAGAA
AGGGCTCAATATTGAGAAAAGCTGCTGTAAAATCAGTTATTTAGGTCACTAGAATCAGAGAAGTGTCTTC
TGTAATCTTGCTGTAGTAAATAAATAAAAGTACATAAATCTTATTTATTTAATGCATTTTTATAGTAATG
GTTCACAAATTTGGGCTTATTAATTAAATGCAAATAATAAAGTGTGTTATGCCATTTAAAATAATTAAGT
GCATCTAGTCATGCAATTGTATTTTTAGCTGAGACTTGTGTGACGTCTTCACTTGCCTGCACTTGAGGAA
AACACATTTAACCACGTGTCAGTTTTTCTGATGCAGGACTGAATTTGGTAGACCTTATACAGCCTACCTA
TGTTAAAAGTAAACAAACATAATATTTAGATTCTCTATTTTACACCGCAGCCTCTTATTTTATCCCTTAA
GGCTCAGCTTTGATAATGTAAATTACATGGATTTTTTTGTCCACAGTGTAAAATATATTCATGTCTTAAT
GACTTGAATTCCACCATCTCATTACATATGCACAGATCTATAAATATGCTAATTAGCCCCCACCTCAACG
CCATCACAGCAGCTCTGAAAAACCAAACAATAGAAGCGTTACACAACAGAGACCCAATGAAGAGTGTTAA
TTAACATAACGCCAACATTTACCACAGATGTACTGTAGTGACGCTAAAATAACCATGCTGCATCTGATGG
AAAATAAAATAGATCAATTATCTATCATTTCATTAGTCAATGCATGATGTAACCTATTTATAAAGCATTT
TTATTTATTTATTTTTTTAGTAAAGTATGCAAACTGAGCGAGCTAGAAAGCACTGGAGCAACTGTAATCA
TATATATCTTCTGTTGTTTTTTGGCATATAGGCCTATAAAAATTTTTGGGAGCATCATCACACTCCTTTT
GTATTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTATTTTTTTTTCAGTTTCCAAGTTTACATACTGATATAT
GGTACACAGGGTTTTCCACATCAAGAGAACAATCAAAACAATCCAGTCAAAACTAACTCTGATAATACTG
ATTTATTGCTTGTGTACTCATTTGTTCGTAGGGAACTGAGGATGGTGCTGTTTAGTTGTTTTGTTGTTAT
ATCTATAGGTACTGTTCGTCATACTATATCCTGTTTGTGATCTTTTAATATTGTACAGCAAGTCAGCGCA
GTCGAAAGCATTTACTGTTCAGCGTGTCTTCTCAGTCTGAGATGCTAAAAATAATCTGTGTGTGTTTCAG
AAAGGTGAATCTGTGAAGAAGATGCGGGAGGAGGTGAGAGGCTGTTCTTCAGACGTGTTGATGGTTGTGT
TTGAGTGATTGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGCAGAGCGGTGCGCGGATCAACATCTCGGAAGGG
AACTGCCCTGAACGCATCATCACGCTCGCAGGCCCCACCACCGCCATCTTCAAGGCCTTCTCCATGATCA
TTGAGAAGCTGGAGGAGGTGCTCTCTAGATCTTTATACGCACATTAGACATGCATACACGTATTCAGCCA
TTCAGATGATGGTTTTGGCGTGACATCGCAGCATTATGAATTATTATTGACGCCCCCTGCTGGGCAAAGC
ATTACCTTCTCCCACTGACTGCCAGCTCGCGGGCTGAGTGATATCTTTTATTATTATTATTTTTTAGCCA
AAACAACAGATAATTGTGCACAGAGGTTTTATTGTTACTAGCAAGACACGCGTCTGAGCTGTGTTCTGCT
GAATTCCCTCAGAAAGATCAGCCAGAAAGGAGAAATTATTAGATTTGTGCTGAATGTTAGCATGATTGAG
CCATAACTGCCTATGCTACTATAGCAGTCAGTGCGTTTGTCTGCTGTTATACAGTTTCTGCTCTAATTTG
CAGGTGAACTGTAATTAAAATATTAATTAAAATCAAAGTCAAATTGGAAATAACATTGATAAAATGTGTG
GATGAGCTGTTCTGAGATCTGTGTCTGTCAAGGACAGATCTCTCCGTCCTCCTAATCATGATCAGCAGTG
CAGCGACTGTTCAATCTGAATTCATATTCGATCCTCCACATCAGCAAAATGACATGAAATTCATCGTAGA
TGGTTTTAGTTTTACATTGAGAGCAGATTTTCTTTAGTATTAGTATTCAAGTTTCTTAATCCTTTATAAG
GCAGAACTGCTGTATAAATTAATTTAGCATCAAATAAACATTTTAATATTAAACATAAACAAGATTGGCC
ATGTCTAATACGCAGAAACTGTGCTGAAGCTGCCGGGTCGGCCTTTAAAAGGACCTGTTGGTATCTGAAA
ATGATCCTAGTCACTAATTAATGCTCTCTTTGAGCCGCTTGTGTGGGAAAAGCCCCGTAAGACAGTGTTT
GCACTTTTATTTCAGTGTAGATTACATTAAACGCACATATATACATGTATAAAGCTTCTTATTTTTCATT
TTTAGTATATTTTTACTATTCAGCTATTTTGCTGATTAATAGTGTACATGTAACCTATAGTGTAAGAAAG
TCTTCAGTAAACTCTTTCAGTATCAGCTGTGCTTGAAATGAGCCGATCTAATGCTGTTCATGTGAAATGA
GCTCCAGAGCTGCTGTTATGACAGCAACTCTCAGATGAGTTTTTAAAATCAAAACCAATAACCAAATCCA
GCTAATAGAGTAATGAATACAGAACAGACCGCAGGTCTGAACTGTGTGTGTGTGTGTTTATCAGGACATC
AGCAGCTCCATGTCCAACAGCACGGCCACCTCCAAGCCGCCGGTGACGCTGCGGATCGTGGTTCCGGCCA
GCCAGTGCGGCTCACTCATCGGCAAAGGAGGATGCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGGTGCGGGACACAGA
GCCACAATACACACACAGCAAACACTGCTTTATTACTGAGAGTGTTTCCCTTGTTTCTAGTCCACATTTC
TAAAACGGAGAATTTTCTAGACCAGCAAAATGGCCTCGTGTTCAGAAATGAGTCAAAATGAAGTGAGCTT
TTCCTTAAAAGCAAAATGATCTGCCACTGGGGGAGCCAGAGTAAACTTATTCCAAAACAAACAAAAGCTA
GGTTATTTCACTCGCCCCATTGGCAGAGGATTTGTTCATTTTAAAGATTTTTTTTCATTTTGACATAAGC
TGCGTCCCAAATGGCACACTATGCACTATGTACTTATGCACTTACACACTCAGCAGGATAGTACATGTGT
ATATTGTCATCACAAATGGAGCACTAATGTTTTTTTACTAAGCGGAAATTCAAACCGTTTCACTGATGAC
GTTTGACGGTTGCCAAATCAGTGAAATAAATGACCAAATTATCAAATAATACCCGCCGTGAGTATAACCG
CATTCACCATCAGGAGGCGCTATAATCACTCTCATAGGAGAATTTTGCTTTCACAATCCACAATTAATAA
AGTTATCCAACATGTGCGCCCGATAGCTCCACCCTTTCCGCTATGTGAGCAAACCTGCGGTGGTTGAGTG
TGTGACGTGTCCATCATTACACACTTCACTTTAGCGGCTGAATGAGTGCATCATCCGGGTAATTAAAGTG
AACTTATTATTGTTAGATTTTACAGTGTGAACGCACTGCTTTCACTATTTATACTACAAAATGGCGTAGA
ATAGTGCACAAGTATGTGATTTGGGACGCAGCTTCTATTTGTGCACTCCTGCTTAAAAGTAGTTTATTTT
TTATTTCATGAACTCCTGAACACAACATCTATACTACTATATTGAACTATTGAGAACTATTCAATGTGTT
TAATAAATATAATGACACAAGCATGTCTAAAGTGTTGTGCATTTTTAATCCTCTGACTGTAGACTGTTGA
AGGACAGTTTTTGACTGGATCATTAAAATACCAAATATTCTTGCAGATATGTGTTTTTAAAAGTGTGCTT
AGGTCATATAAATGCTTAACAATAGCTTTTAAAATGCACAGCTGGCTCTATTAAAGTGGTGTGTGAGTCT
GTTCTTTTAAATCTCTGAGAGCAGCAGAATCTCGTGTCGAATAAAGAAATGTGGCCTGAAAATAGTGTTA
TTTTTGTGTGTGTTGTGCAGTCGACTGGAGCTCAGGTACAGGTGGCAGGAGACATGCTGCCCAACTCCAC
CGAGAGAGCCATCACTATCGCCGGGACCCCGCTGTCCATC