LncRNA Gene

ZFLNCG03308

Basic Information

Chromesome: chr5

Start: 33542462

End: 33549693

Transcript: ZFLNCT05078

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
ERR023145 heart normal 44.05
SRR800045 muscle normal 30.31
SRR891495 heart normal 20.28
SRR1562531 muscle normal 17.07
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SRR700534 heart control morpholino 4.38
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ERR145648 skeletal muscle 27 degree_C to 27 degree_C 3.69
SRR516122 skin male and 3.5 year 3.58
SRR065197 3 dpf U1C knockout 3.17
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
alpk3a 0.84
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LOC572412 0.82
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ptrfa 0.79
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT05078 ENST00000582367; NONHSAT052724; Collinearity with conserved coding gene
OMIM
OMIM Phenotype
613443 Mental retardation, stereotypic movements, epilepsy, and/or cerebral malformations
Sequence Download
>ZFLNCG03308
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GGCATCAAGATCTGAGTGAGAAAAAGAATTGAATTGGTTTACAATCATTTGATCTAAACATTTACCATTG
GACAATATCTCTTTGACCTCTGTGTTTGAATCATCCAGCATGTAGATCTTTGGATCACATACACCTTTGC
CCAGACGTACATCTTGAATTTTACCATTTCCACCTGACAATTCAAATAAAGGAGAAGTATTACGTCTTCT
ATTAGGAGGGCCATCACAATCTTTCCTCCATTCTGTGGATCTTGCCTGAACAGCTTTCGGATAAACAGAT
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GGATGGAATGTGCTTAATGCCTTTTGTTCAAAGTCCTCCTCAATCCTCAACTGGACTAAAGCTGTGTCTG
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AGACTCACCAAATGGAGTATGCAAGATTTTGTCCTTACCTTCAGTTTCACCCCATTCAGGAAGTGCGGTT
TCTTCTTTTCCCAGCAATGGTGAATGGAAAGTTGGGTTTCTTTGGTCTTTCCTGAGGTTTTCTTTGGGTG
TTACTGTGAAATGTGTCTTTGGTGTGTCATTGGGTTCTTTTAAAATACACATTAACGTATCTGGAGTGAT
ATTTTTGTCCACTTGTAAATTATCCTGGTTACTGGCGTGACCTGAATATGAGTGGAGTCCAGCAACTGAC
GGACTTTTGGCTACAATCACCGGATGTAAAGAATCAGCTCTGTCTAAATACTCAAATCCATCCGCATCAG
TACTTTCTGTGGGCCAAACAGTTCCAAAACTGTCTTTATCATTACTTTTCCCAATATCCCTACAAAGGGT
CTGAAGTTCGCCTTTATCTTTACGCTCTGAATCTCCTACATTCTGGAATGGGTGACTTTCAAGTAATTTA
TCCTTTTCAGATTGCAATGAGAACTTCCTGTGTATTTCACCGCTGGTCTTTCTGACTGCCTCTAACATCC
CGTTGTATCTCTCAGACATTGTCCGTCTCTCATTTTTCACAACACTCACGGCATCATCTCTCGTGTCCCC
TTGGCAAGAGCTTTCTAACATGTTTGGAGTGTCCTTGAGGTGAGTTTTGTTAGTCATTCTGTCTGCTTTG
TCTGGTCGTTGCTGGTCCTCTGTGGCAGATATATTGGTGGTGGTTGCGTCGCTTAAGGCTGTTTTGAATT
CTGAGGCACGTGGACGTCCCGCCAGGCTCAGTTGAGGATTTGGTGTCCTGGCATTCTGCAAAACATCCGT
GTCATAACTGTTACTGATCTTTTTTCCTCCCCGCTTGAAAGAGGGCTCAGTGTTGTTGTCATTAAGTCTT
GTTGGTTGCTGACTTGGATAGATCTTTAGCTTGGAGGTGTCCAGTTGAATGAAATTCTCTTCTGGGCTGT
TGGAATGTGCTTCTTCCTCACTTTCGCTTAAAATTTCGTAGTCACCAACAGTCAGGACATCTTCATTTTG
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CTTTATCTGTAATCAGCCCCCTCCCGGCTCTCTCTTGTTCCCCTCACATCACTCCTTTCTGGAATGCTGC
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GTGGACTAGATCAGTTACCAGGTGCGAAGGTCACATTAGACATGAAAGGGGAAAACCCATGGACTCCAAA
CATATCCCACGACTCTTGACAACAACACTCCAGACCTCTTGACCAATATAACTGCTCTTCCATTCCAGCT
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AAGAACTGAAATGAGTTATAATTCAGAATTAATTGTTACATATTTTGGATCATAAATTTTTTTAAAGAAG
TGTCTTGTGCTAAATTTAATTGATTAAATGTGCAGTAGAATTACAGCAAAAAGTGCCAACACAGGCTCAT
TCTGAAAACGTAGCCCTATGTAAGTTTCTGGAGATCGCGAATTATGTTGCCAGAAGTACTTATGGCTGCA
TTTCATCTTTAAAACGAATGCTACAGGGTGGAATGTTTAATCTTTAATCTTTTTTCGATTATCAGCTGAC
TGCTTACCTCCGTTTGGACGGCTTTCATGCTGTTATGCCTGATTCACACAGGGCTTTGGCATCAACACTT
GACAGAATGCATGTCTAAGTTGGGGCTGACGTGATCGTCAAAGCAATCTCACCACAATCGACTACTGTCT
GAGCTAGTGGATTTGCATAAAGCGATATGATTGGCTGACACGTCCATTGGCACTTGAAAAGTTGAGAAAT
TCCCAATTTTTGCAGCGAGAAACGACACTGAAGCGGCACCGACGGATCCACAATACAGTTTGGCAATGCC
TGACGTCTCCCATTTAAAGTAAATAGGAAGCGTTAACGCTGACGCCCGGTGTGAATGGGGCATTATCAGT
TTGTCTGGTAGCTTGCCATGTATGTCGACGGACTTGGGATGCAGAGAGGAGCTGACCAGGACGATAGGAT
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TCTGGATTGCTTTTTAAAACTGACTGTTGGGTGTAAAGAAGTGGGTGTTTGGGTCAATCTGTGCTTTTGA
AAACACAAAATGAAAACAATTTTGGTTGAGTTTAGGCAGGACCGGATTAAGAGCTCAGGGGCCCCTGGGC
ACATTGTCTTGTAATGCCCCCTAACTGGCCGCACCCCTATAGTTGAATTAAAAAAAAATAATAATATAAT
AATTTTCAAATAAAATGAATCTATAATTTGTTGCCCACATATTTAATTAAATGATATATAGTACATATGT
ATTTATAGTCTACAAAGATTTAACTTATTTTTCAAAGCATTGAATAAAAATACTAATAATATATATATAT
ATGTATTGCTTTTACAAACTTATAAAGCATATTATTGCCATGGCATATAACGCACAATGCTTCTCCAATC
CAGTTCTATGAATCTGAGTTCTATATAGTTTTTCATAATACAAACACTGATTTACTGTCTCTCTCCTCCT
CTCCCTGTATTTTCTCTACTCTTCTCGTGATGAAGACTTGATTATAAACCAAAAAGTATCCGAAATCACA
CACACTATACCTCTTCTCTCCCGTCTCTCCCCTCTTCTGGGCCTTTCTCTCTCTATTTCCCTCTCTCTCT
CCTTTTCTGTCTGTCTCTCACACGATGAATCCAGTCCGCGCTGCGCTGCCGTTAGCCTCCTCCGCCTGGT
TAATGCTAGCTTCTCATCATTTAAAGTAACCATAACGTCTTCTTTTGTACCCTCATTCTCCTGATCATGG
GTCTGTTTAAAGATGGTATGTATGGAAAATACCTCATTAAAGATGCCTCCTCTCCTCTTTCTCTCGCGTT
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AAGTGCGGGTTATTACAAAACTGACGTTTCCGCGCTTGACCAATTAGCATTCTGTTTAGTTAACGAAAAA
AGGCAGTTTAAATATAATAATAATATTAATATGTGATCGCAATTTTTTGCTCAGAGGAAATACAGTTGTC
TTAGCAATATAGTTTTTGCAGAGAGGGAGGCACCTATAATAAGGCTAAACATTATTAAATACCCACGAGA
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GGATTAATAGCTCTTTACTCATCTTGTCTCTATCAATCAGGCATCGATGGGCGTAAACCCTGAATAGCTT
ATTCCAACTAGATGCGCTATTTGCAATTAGCCAAAAAAGACACTCCGAAATTGTCTTTTTTTCTCCCCCC
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GAGTTTAGGGAAGGGGGAGGATGGGTCAGTCAATCTGTCAGTCAGTCAGTTGACAGCGGCAACAAGTGGA
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CAAAAACTGCAAAAAAGTACCTCCTGGGACTTATATGACCCTCCCAGAAATTATATATAAATATTAATAA
TTAATAATTATTATAATTAGTAGTAGATTTAAAAAAAAATAAATAAAACTTAGTTAACTAAATAATGTGT
ATATTGTATATTCATTGATACTATTTTGACATAATTTGATTATTTATATTGTTTATAAAAAACATAATTT
AAGAATGTGCATATCTTTCTGTCTATTTAAATCCTAAAATTAGCTTTAAAGCATGTGGTTGAAAACCCAT
TATACAGTATACAAAAAAGCATTTTTGAAATGCTTAAATCTCCAAAATGTTAAACCATTTTGTCATTTTG
ACTTTGCTAATTCTCAAATCAACATGTGTTTTCCATACAGCATTTCATTATAATAAAATGGATCTACAGA
TCTAATAATCTGGCATCATATCAGGGTCATATGAACCCTGTGACCTTTGACTAAGTATCAGAGCTTTGTA
TCAGTGACCTTTTAAAACGTACATTACCCAGCCTGAGTGCTTGAGAGTAAGAAATAACCCATAATGATCA
GCTGACTGTAGTGTCACAATGTGTCTCATGGGAAGACTAGTTTAAAATAGCCTCTCACGTATAAGCGTAT
GATAAGGTGTAAACAGGTCCTTTGTCCTCTGCATGCTAATTTAAAAACTGACACTTTTAATCAGACATAC
AAAAATGCCAAATAATGAGGATAATGTAAAACTAATAAAGAGTAAGAAATCTAAATTCACTAGGTTTATT
TTGCTATTTTTCAGGGTCTGATTATTTTCTTTGGCATTTGGAGTGGCGGTACTTCTCTGTTGTCGTCAGT
TCGAAGGGTTTAGCCACAATATTGTTAACCACGCTCCTTTTGCTGTTAGTTTGCTATGAGGGAATGGTGC
GCAAAAAAAGCCCTACCCCTACTTAATAATTGACTTAAGTACATAAACATACTGAAATAAAAGCAAGTTT
CAGTACACGCCAACTTTTAAAGCTATAAGTTCAGCCAAAAAATAAGAAAGTGTATGCACATTTGCACTAA
AGAAACTTTCTTAATCACTCCATGTCTCTTGGAAAACATACACTATGGCCAAGCTTATTCAATTAACCTA
TAGGACTTGTCTTTGGACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCCGGAGAAATCCCACACCAACACGGGGAGAAC
ATGCAAACTTCACACAGAAATGCCAGTTGGGACTCGAACCAGCAACCTTCTTGCTGTGAAGCCACCATGT
CGCCTCATGTTTGTTTGTGGATAAATGTAAATAAATAACAGATCATGTAAAAAAAAAAAAAGATCATTTT
GAGGTGAATTATTTCTTCAAATGGATAGTTATCCCCCCAAAAATTACCAGCTATTTACTTAAATTAACGA
AAGCTGAAATCCTGTAACTATTGACTTCCACAGTCAGGAAAACAAATACTATGGAAGTCAATAGGGCGAA
GCAGTGGCGCAGTAGGTAGTGCTGTCGCCTCACAGATAGAAGGTCACTCGAGTTGGCGTTTCTGTGTGGA
CTTTGCATGTTCTCCCTGCATTCATGTGGGTTTCCTCCAGGTGCTCTGGTTTCCTGCACAGTCCAAAGAC
ATGCGGTACAGGTAAATTGGGTTGGCTAAATTGTCCGTTGTGTATGTGTGTGTGTATGAATGAGTGTTTG
GATGTTTCCCAGAGATGGGTTGTGGTTTATTCAAAATATCTCCTACTTAGAAATAAAGATAAACAGGATT
GGAACAAGTTAAGGACAAGTAAAATATGACAACATTTTCAGTTTTGGGTGATTTATCCCTTTAGGCAGGT
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CTCTCTCTCTCCTTTTAAGTTGAGCACAGAATTTAAGGCTTGAGGAAAGTAGACACTCAATATGAAGGTG
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TTTCTGCGCAATGACCTCAATCAATTTTGGGTGACAATACATATAGTATATGACCCATCACATTTAAATG
ATCTATAATGTTAGCTGATTGTGCAACCTTTCATCTCATCTGAGTGATTTTTCACATTTTTCAGATAGCT
ACTGATGTTAAGAAGTTGTCC